DNA Extraction
The first step in the laboratory is DNA extraction. All of the plates, each containing 95 specimens or legs, are incubated overnight in a special solution that extracts DNA from the cells. The next day, the DNA is separated from other cell materials using one of our robots, lovingly called Franklin (after Rosalind Franklin, who helped to discover the structure of DNA in the 1950s).
PCR Amplification
The second step in our analysis employs a clever technique called the polymerase chain reaction or PCR. By adding a cocktail of reagents to the DNA, then rapidly heating and cooling it several times, we can create millions of copies of the DNA barcode region for the sample of DNA in each well. All these copies are necessary for the final laboratory step — DNA sequencing.
DNA Sequencing
Each well is analyzed by one of our DNA sequencers, using a laser to read the letters (A, C, G, and T) of each DNA barcode. And there you have it, that’s how we determine the DNA barcode for each insect (or other invertebrate) caught in a Malaise Trap!
Next Step: Analyzing the Data
Français
Extraction de l’ADN
La première étape dans le laboratoire est l’extraction de l’ADN. Toutes les plaquettes, contenant chacune 95 spécimens ou seulement leurs pattes, sont incubées pendant la nuit dans une solution spéciale qui extrait l’ADN des cellules. Le lendemain, l’ADN est séparé des autres tissus cellulaires à l’aide de l’un de nos robots, affectueusement appelé Franklin (référence à Rosalind Franklin, qui a aidé à découvrir la structure de l’ADN dans les années 1950).
Amplification par PCR
La deuxième étape dans notre analyse utilise une technique intelligente appelée « réaction en chaîne par polymérase » ou « PCR ». En ajoutant un cocktail de réactifs à l’ADN, puis en le chauffant et le refroidissant rapidement à plusieurs reprises, nous pouvons créer des millions de copies de la région du barcode d’ADN à partir de l’échantillon d’ADN présent dans chaque cavité de la plaquette. Toutes ces copies sont nécessaires pour la dernière étape de laboratoire : le séquençage de l’ADN.
Séquençage de l’ADN
Chaque cavité est analysée par l’un de nos séquenceurs d’ADN, en utilisant un laser pour lire les lettres (A, C, G et T) de chaque barcode d’ADN. Et là vous l’avez enfin, c’est de cette manière que nous déterminons le barcode d’ADN pour chaque insecte (ou autres invertébrés) attrapé dans la trappe Malaise!